УДК 616-093

Применение НИПТ на основе SNP в системе пренатального скрининга в Республике Казахстан

Садырбекова Айгерим Толегеновна – врач-генетик «Центра молекулярной медицины» (Республика Казахстан).

Орманкызы Айжан – врач-генетик «Центра молекулярной медицины» (Республика Казахстан).

Святова Гульнара Салаватовна – доктор медицинских наук, профессор Научного центра акушерства, гинекологии и перинатологии Министерства здравоохранения и социальной защиты Республики Казахстан.

Аннотация: В данной статье рассмотрено применение НИПТ на основе SNP в системе пренатального скрининга в Республике Казахстан. Цель исследования: Определить клиническую значимость НИПТ Panorama в пренатальной диагностике хромосомных анеуплоидий плода и разработать критерии его включения в систему ПС РК.

Ключевые слова: пренатальный скрининг, синдром Дауна, неинвазивное пренатальное тестирование, инвазивная пренатальная диагностика.

Цель исследования

Определить клиническую значимость НИПТ Panorama в пренатальной диагностике хромосомных анеуплоидий плода и разработать критерии его включения в систему ПС РК.

Материалы и методы исследования

После заполнения официального информированного согласия, НИПТ Panorama прошли 4103 беременных, из них - биохимический пренатальный скрининг 1 триместра беременности (PAPP-A, β-hCG) – 3343 (81,5%), УЗ исследование – 4103 (100%). Все 4103 беременных прошли обязательное пре-тестовое и пост-тестовое медико-генетическое консультирование, на котором были информированы о показаниях, преимуществах и ограничениях НИПТ Panorama. Высокий риск был выявлен у 106 (2,6%) женщин. Инвазивная пренатальная диагностика (биопсии ворсин хориона, плацентоцентез) с последующим кариотипированием, была проведена беременным группы «высокого риска» по результатам НИПТ Panorama. Статистическая обработка проведена с использованием биоинформационной системы STATA.

Полученные результаты

Показаниями для прохождения НИПТ Panorama явились: возраст матери 37 лет и старше – 615 (15%); отклонения в СМ– 1805 беременных (44 %); наличие УЗ маркеров ХА – 427 (11%); два и более показаний – 742 (18%); первичный скрининг методом НИПТ Panorama прошли 504 беременных (12%).

Средний возраст на момент сдачи НИПТ составил 34,3±2,16 лет, достоверно более старший возраст 39,9±2,04 лет отмечен в группе с возрастным фактором, наименьший возраст – в группе первичного скрининга и при наличии у пациенток УЗ+ СМ – 30,5 ±3,44 и 32,2±3,18 лет, соответственно. Средний вес обследованных составил 61,9±4,31 кг, достоверных отличий в группах по весу беременных в зависимости от показаний для НИПТ не обнаружено.

Средний срок беременности составил 15,8±1,9 недель, достоверно в более ранние сроки 9,7±1,2 недели прошли НИПТ Panorama беременные с наличием возрастного фактора; в достоверно более поздние сроки – 18,1±2,6 недель направлены беременные с наличием УЗ и/или СМ. Средний выход фетальной фракции составил 11,7±1,9% и напрямую коррелировал со средним сроком беременности на момент забора крови.

Из 4103 обследованных НИПТ Panorama, высокий риск ХА плода выявлен у 37 беременных (2,3%), из них - трисомии 21 у 56 пациенток, трисомии 18 – у 15, анеуплоидии половых хромосом – 13, другие патологии (трисомия 13, синдром Прадера-Вилли, синдром Ангельмана, триплоидия) - 22. Показаниями для прохождения НИПТ Panorama у беременных с высоким риском ХА в 43,3% явились наличие двух и более факторов риска – возраст матери, наличие СМ и/или УЗ маркеров; 56,7% беременных имели либо старший возраст, либо изменения в концентрации СМ. Стандартную подтверждающую инвазивную диагностику 95 прошли беременных. 11 (10,3%) беременных от процедуры инвазивной пренатальной диагностики отказались. Диагноз синдрома Дауна подтвержден в 100% случаев (PPV-100%). По другим синдромам PPV также совподало с исследованиями, проведенными компанией Natera. Анализ исходов родов у 3806 женщин, прошедших НИПТ Panorama, не обнаружил ни одного случая пропуска ХА плода.

Выводы

  1. Первые результаты внедрения НИПТ Panorama в РК, в отличие от общепринятого биохимического ПС, показали его высокую диагностическую значимость, достоверность (FPR-0%) и абсолютную безопасность для матери и плода. 
  2. Наибольшей информативностью в возможном риске ХА плода обладают: наличие у беременной двух и более неблагоприятных факторов: УЗ маркеры + СМ и УЗ маркеры + возрастной фактор.
  3. Внедрение НИПТ Panorama позволило избежать проведения 3493 (97,1%) инвазивных процедур у 3599 беременной, направленных на второй этап ПС, что снизило число осложнений от неоправданных инвазивных вмешательств и принесло значимый социально-экономический эффект.
  4. Проанализирована экономическая эффективность НИПТ Panorama, что свидетельствует о его высокой диагностической значимости и необходимости использования на втором этапе ПС у беременных «среднего генетического» риска.

Список литературы

  1. Pergament, E.; Cuckle, H.; Zimmermann, B.; Banjevic, M.; Sigurjonsson, S.; Ryan, A.; Hall, M.P.; Dodd, M.; Lacroute, P.; Stosic, M.; et al. Single-nucleotide polymorphism-based noninvasive prenatal
  2. Futch, T.; Spinosa, J.; Bhatt, S.; de Feo, E.; Rava, R.P.; Sehnert, A.J. Initial clinical laboratory experience in noninvasive prenatal testing for fetal aneuploidy from maternal plasma DNA samples. Diagn. 2013, 33, 569–574. [CrossRef] [PubMed]
  3. Ryan, A.; Hunkapiller, N.; Banjevic, M.; Vankayalapati, N.; Fong, N.; Jinnett, K.N.; Demko, Z.; Zimmermann, B.; Sigurjonsson, S.; Gross, S.J.; et al. Validation of an Enhanced Version of a Single-Nucleotide Polymorphism-Based Noninvasive Prenatal Test for Detection of Fetal Aneuploidies. Fetal Diagn. Ther. 2016, 40, 219–223. [CrossRef] [PubMed]
  4. Ravi, H.; McNeill, G.; Goel, S.; Meltzer, S.D.; Hunkapiller, N.; Ryan, A.; Levy, B.; Demko, Z.P. Validation of a SNP-based non-invasive prenatal test to detect the fetal 22q11.2 deletion in maternal plasma samples. PLoS ONE 2018, 13, e0193476. [CrossRef] [PubMed]
  5. Wapner, R.J.; Babiarz, J.E.; Levy, B.; Stosic, M.; Zimmermann, B.; Sigurjonsson, S.; Wayham, N.; Ryan, A.; Banjevic, M.; Lacroute, P.; et al. Expanding the scope of noninvasive prenatal testing: detection of fetal microdeletion syndromes. J. Obstet. Gynecol. 2015, 212, 332 e1–332 e9. [CrossRef]
  6. College of American Pathologists. Laboratory General Checklist. 2018. Available online: http://www.cap.org (accessed on 5 May 2019). 6. Skotko, B.G.; Allyse, M.A.; Baj
  7. Gil, M.M.; Accurti, V.; Santacruz, B.; Plana, M.N.; Nicolaides, K.H. Analysis of cell-free DNA in maternal blood in screening for aneuploidies: updated meta-analysis. Ultrasound Obstet. Gynecol. 2017, 50, 302–314. [CrossRef] [PubMe

Интересная статья? Поделись ей с другими: